Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffbO54788 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffbO54788 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffbO54788 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffbO54788 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffbO54788 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffbO54788 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffbO54788 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffbO54788 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffbO54788 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffbO54788 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffbO54788 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffbO54788 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffbO54788 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffbO54788 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffbO54788 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffbO54788 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffbO54788 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffbO54788 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffbO54788 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffbO54788 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffbO54788 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DffbO54788 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffbO54788 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffbO54788 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffbO54788 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffbO54788 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffbO54788 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffbO54788 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffbO54788 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffbO54788 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffbO54788 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffbO54788 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffbO54788 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffbO54788 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffbO54788 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffbO54788 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffbO54788 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffbO54788 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffbO54788 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffbO54788 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffbO54788 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffbO54788 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffbO54788 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffbO54788 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffbO54788 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffbO54788 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffbO54788 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffbO54788 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffbO54788 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffbO54788 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffbO54788 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffbO54788 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffbO54788 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffbO54788 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffbO54788 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffbO54788 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffbO54788 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffbO54788 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffbO54788 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffbO54788 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffbO54788 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffbO54788 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffbO54788 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffbO54788 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffbO54788 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffbO54788 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffbO54788 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffbO54788 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffbO54788 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffbO54788 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffbO54788 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DffbO54788 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffbO54788 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DffbO54788 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffbO54788 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffbO54788 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffbO54788 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffbO54788 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffbO54788 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DffbO54788 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffbO54788 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffbO54788 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffbO54788 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffbO54788 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffbO54788 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffbO54788 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffbO54788 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffbO54788 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DffbO54788 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DffbO54788 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DffbO54788 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DffbO54788 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DffbO54788 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DffbO54788 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DffbO54788 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DffbO54788 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffbO54788 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffbO54788 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffbO54788 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms