Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CaluO35887 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CaluO35887 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CaluO35887 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CaluO35887 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CaluO35887 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CaluO35887 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CaluO35887 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CaluO35887 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CaluO35887 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CaluO35887 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CaluO35887 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CaluO35887 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CaluO35887 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CaluO35887 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CaluO35887 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CaluO35887 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CaluO35887 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CaluO35887 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CaluO35887 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CaluO35887 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CaluO35887 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CaluO35887 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CaluO35887 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CaluO35887 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CaluO35887 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CaluO35887 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CaluO35887 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CaluO35887 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CaluO35887 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CaluO35887 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CaluO35887 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CaluO35887 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CaluO35887 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CaluO35887 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CaluO35887 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CaluO35887 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CaluO35887 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CaluO35887 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CaluO35887 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CaluO35887 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CaluO35887 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CaluO35887 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CaluO35887 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CaluO35887 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CaluO35887 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CaluO35887 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CaluO35887 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CaluO35887 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CaluO35887 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CaluO35887 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CaluO35887 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CaluO35887 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CaluO35887 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CaluO35887 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CaluO35887 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CaluO35887 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CaluO35887 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CaluO35887 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CaluO35887 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CaluO35887 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CaluO35887 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CaluO35887 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CaluO35887 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CaluO35887 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CaluO35887 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CaluO35887 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CaluO35887 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CaluO35887 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CaluO35887 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CaluO35887 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CaluO35887 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CaluO35887 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CaluO35887 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CaluO35887 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CaluO35887 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CaluO35887 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CaluO35887 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CaluO35887 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CaluO35887 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CaluO35887 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CaluO35887 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CaluO35887 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CaluO35887 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CaluO35887 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CaluO35887 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CaluO35887 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CaluO35887 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CaluO35887 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CaluO35887 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CaluO35887 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CaluO35887 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CaluO35887 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CaluO35887 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CaluO35887 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CaluO35887 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CaluO35887 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CaluO35887 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CaluO35887 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CaluO35887 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms