Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc27a2O35488 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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