Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms