Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad6O35182 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad6O35182 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad6O35182 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad6O35182 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad6O35182 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad6O35182 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad6O35182 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smad6O35182 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smad6O35182 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms