Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Nedd9O35177 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms