Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms