Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MttpO08601 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MttpO08601 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MttpO08601 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MttpO08601 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MttpO08601 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MttpO08601 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MttpO08601 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MttpO08601 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MttpO08601 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MttpO08601 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MttpO08601 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MttpO08601 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MttpO08601 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MttpO08601 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MttpO08601 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MttpO08601 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MttpO08601 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MttpO08601 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MttpO08601 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MttpO08601 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MttpO08601 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MttpO08601 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MttpO08601 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MttpO08601 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MttpO08601 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MttpO08601 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MttpO08601 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MttpO08601 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MttpO08601 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MttpO08601 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MttpO08601 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MttpO08601 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MttpO08601 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MttpO08601 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MttpO08601 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MttpO08601 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MttpO08601 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MttpO08601 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MttpO08601 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MttpO08601 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MttpO08601 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MttpO08601 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MttpO08601 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MttpO08601 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MttpO08601 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MttpO08601 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MttpO08601 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MttpO08601 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MttpO08601 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MttpO08601 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MttpO08601 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MttpO08601 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MttpO08601 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MttpO08601 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MttpO08601 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MttpO08601 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MttpO08601 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MttpO08601 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MttpO08601 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MttpO08601 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MttpO08601 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MttpO08601 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MttpO08601 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MttpO08601 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MttpO08601 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MttpO08601 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MttpO08601 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MttpO08601 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MttpO08601 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MttpO08601 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MttpO08601 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MttpO08601 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MttpO08601 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MttpO08601 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MttpO08601 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MttpO08601 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MttpO08601 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MttpO08601 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MttpO08601 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MttpO08601 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MttpO08601 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MttpO08601 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MttpO08601 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MttpO08601 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MttpO08601 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MttpO08601 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MttpO08601 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MttpO08601 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MttpO08601 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MttpO08601 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MttpO08601 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MttpO08601 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MttpO08601 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MttpO08601 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MttpO08601 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MttpO08601 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MttpO08601 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MttpO08601 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MttpO08601 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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