Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
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Gm3278L7N2D2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Gm3278L7N2D2 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Gm3278L7N2D2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Gm3278L7N2D2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Gm3278L7N2D2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Gm3278L7N2D2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3278L7N2D2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms