Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms