Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Gm3336J3QMQ6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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Gm3336J3QMQ6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm3336J3QMQ6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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