Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lipo1J3QME6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms