Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm21897J3KMP5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm21897J3KMP5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm21897J3KMP5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm21897J3KMP5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm21897J3KMP5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm21897J3KMP5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm21897J3KMP5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm21897J3KMP5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm21897J3KMP5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm21897J3KMP5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21897J3KMP5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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