Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms