Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms