Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5160F8VPN3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5160F8VPN3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms