Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8220F6YKI2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8220F6YKI2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8220F6YKI2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8220F6YKI2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8220F6YKI2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8220F6YKI2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm8220F6YKI2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm8220F6YKI2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm8220F6YKI2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm8220F6YKI2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm8220F6YKI2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm8220F6YKI2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm8220F6YKI2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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