Protein–RNA interactions for Protein: F6VWU8

Zfp946, Zinc finger protein 946, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp946F6VWU8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp946F6VWU8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp946F6VWU8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp946F6VWU8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp946F6VWU8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp946F6VWU8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp946F6VWU8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp946F6VWU8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp946F6VWU8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp946F6VWU8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp946F6VWU8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp946F6VWU8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp946F6VWU8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp946F6VWU8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp946F6VWU8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp946F6VWU8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp946F6VWU8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp946F6VWU8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp946F6VWU8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp946F6VWU8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp946F6VWU8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp946F6VWU8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp946F6VWU8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp946F6VWU8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp946F6VWU8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp946F6VWU8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp946F6VWU8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp946F6VWU8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp946F6VWU8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp946F6VWU8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp946F6VWU8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp946F6VWU8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp946F6VWU8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp946F6VWU8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp946F6VWU8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp946F6VWU8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp946F6VWU8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp946F6VWU8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp946F6VWU8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms