Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms