Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Y4

A430078G23Rik, RIKEN cDNA A430078G23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430078G23RikE9Q7Y4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A430078G23RikE9Q7Y4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A430078G23RikE9Q7Y4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18■□□□□ 0.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms