Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7U0

Kcnmb3, Potassium large conductance calcium-activated channel, subfamily M, beta member 3, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb3E9Q7U0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnmb3E9Q7U0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Kcnmb3E9Q7U0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Kcnmb3E9Q7U0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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