Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Urb2E9Q7L1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Urb2E9Q7L1 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms