Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Usp31E9Q6Y8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
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Usp31E9Q6Y8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
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Usp31E9Q6Y8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Usp31E9Q6Y8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Usp31E9Q6Y8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
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Usp31E9Q6Y8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Usp31E9Q6Y8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Usp31E9Q6Y8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Usp31E9Q6Y8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Usp31E9Q6Y8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Usp31E9Q6Y8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Usp31E9Q6Y8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
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Usp31E9Q6Y8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp31E9Q6Y8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Usp31E9Q6Y8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Usp31E9Q6Y8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Usp31E9Q6Y8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms