Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20518E9Q548 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Gm20518E9Q548 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Gm20518E9Q548 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm20518E9Q548 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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