Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms