Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms