Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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