Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3298E9PW80 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms