Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms