Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc62E9PVD1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc62E9PVD1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms