Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Soga1E1U8D0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Soga1E1U8D0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Soga1E1U8D0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Soga1E1U8D0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Soga1E1U8D0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Soga1E1U8D0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Soga1E1U8D0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Soga1E1U8D0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Soga1E1U8D0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms