Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms