Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc6D3YZP9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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