Protein–RNA interactions for Protein: D3YWX3

9230113P08Rik, RIKEN cDNA 9230113P08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9230113P08RikD3YWX3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
9230113P08RikD3YWX3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
9230113P08RikD3YWX3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms