Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrc5C3VPR6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrc5C3VPR6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrc5C3VPR6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrc5C3VPR6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrc5C3VPR6 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrc5C3VPR6 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrc5C3VPR6 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrc5C3VPR6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrc5C3VPR6 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrc5C3VPR6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrc5C3VPR6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrc5C3VPR6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc5C3VPR6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc5C3VPR6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc5C3VPR6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc5C3VPR6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc5C3VPR6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc5C3VPR6 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc5C3VPR6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc5C3VPR6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc5C3VPR6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc5C3VPR6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc5C3VPR6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc5C3VPR6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc5C3VPR6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc5C3VPR6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc5C3VPR6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc5C3VPR6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc5C3VPR6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc5C3VPR6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc5C3VPR6 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms