Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cttnbp2B9EJA2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms