Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pdzd8B9EJ80 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms