Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms