Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pnldc1B2RXZ1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms