Protein–RNA interactions for Protein: B2RRL2

Jrkl, Jerky protein homolog-like, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrklB2RRL2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
JrklB2RRL2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JrklB2RRL2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JrklB2RRL2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JrklB2RRL2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
JrklB2RRL2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JrklB2RRL2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JrklB2RRL2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
JrklB2RRL2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JrklB2RRL2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JrklB2RRL2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JrklB2RRL2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JrklB2RRL2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JrklB2RRL2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JrklB2RRL2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JrklB2RRL2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JrklB2RRL2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JrklB2RRL2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JrklB2RRL2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JrklB2RRL2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JrklB2RRL2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
JrklB2RRL2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JrklB2RRL2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JrklB2RRL2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JrklB2RRL2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JrklB2RRL2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
JrklB2RRL2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
JrklB2RRL2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
JrklB2RRL2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms