Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms