Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ythdc2B2RR83 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms