Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itga8A2ARA8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms