Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Rtf1A2AQ19 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Rtf1A2AQ19 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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Rtf1A2AQ19 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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Rtf1A2AQ19 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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Rtf1A2AQ19 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms