Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms