Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms