Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms