Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramel3A2AHA7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pramel3A2AHA7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pramel3A2AHA7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pramel3A2AHA7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pramel3A2AHA7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramel3A2AHA7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramel3A2AHA7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramel3A2AHA7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramel3A2AHA7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramel3A2AHA7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramel3A2AHA7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramel3A2AHA7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramel3A2AHA7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramel3A2AHA7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms