Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ckap5A2AGT5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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