Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms